Ujemny wynik HBsAg świadczy z bardzo dużym prawdopodobieństwem, że pacjent nie jest aktualnie zakażony HBV. Istnieją jednakże sytuacje wyjątkowe, w których nawet pacjent z ujemnym wynikiem HBsAg może być zakażony wirusem HBV, a co za tym idzie może być zakaźny dla otoczenia.

Dotyczy to pacjentów zakażonych mutantem wirusa HBV, który nie wytwarza antygenu powierzchniowego HBs oraz niektórych okresów ostrego zakażenia, w których jedynym dowodem infekcji jest obecność przeciwciał anty-HBc w klasie IgM.